Projet de fin d'étude : Isolement, identification et caractérisation des bactéries endophytes de Thymus vulgaris et étude de leurs effets sur les nématodes à galles du genre Meloidogyne

Etudiant : SALI BOTAINA

Filière : Master Sciences Biologiques et Santé (SANBIOL)

Encadrant : Pr. LYOUSSI BADIAA

Annèe : 2023

Résumé : Les bactéries endophytes sont des micro-organismes qui vivent à l'intérieur des tissus végétaux sans leur causer de dommages. Ces bactéries ont la capacité de produire des métabolites actifs qui peuvent potentiellement influencer la croissance et le développement des plantes, ainsi que leur résistance aux pathogènes. Ce projet de fin d'études a eu pour objectifs : i / d’isoler, d’identifier et d’évaluer les bactéries endophytes à partir de la plante Thymus vulgaris, ii/ d’étudier leur action sur les nématodes à galles, et iii/ d’investiguer leur potentiel ‘’Plant Growth Promoting Rhizobacteria’’ (PGPR). Pour ce faire, des échantillons issus de tissus végétaux ont été collectés, stérilisés et traités pour isoler les bactéries endophytes. Les colonies bactériennes obtenues ont ensuite été caractérisées par des techniques de biologie moléculaire telles que la ‘’Polymerase Chain Reaction’’ PCR et le séquençage du gène spécifiant l'ARN ribosomal 16S. Les bactéries endophytes identifiées, FM37 (Bacillus pumilus) et FM38 (Bacillus stercoris), ont été ensuite évaluées pour leur potentiel d'activité antagoniste contre les nématodes à galles. Nos résultats révèlent que les souches FM37 et FM38 présentent un effet nématicide important, avec une réduction du pourcentage d'éclosion des œufs avoisinant 93% et 86%, respectivement. De plus, nous avons évalué le potentiel PGPR de ces bactéries par la réalisation de tests biochimiques. Nous avons montré que la souche FM37 et FM38 solubilisent le phosphore et le zinc, produisent des sidérophores. Nous avons aussi montré que la souche FM38 fixe l'azote. Nos résultats fournissent des informations sur la diversité des bactéries endophytes présentes dans la plante Thymus vulgaris, et sur leur potentiel d'utilisation dans la lutte biologique contre les nématodes à galles. Ces résultats devraient contribuer au développement de stratégies de gestion durable des nématodes en agriculture utilisant des agents de lutte biologique. Mots clés : bactéries endophytes, Thymus vulgaris, nématodes à galles, lutte biologique.