Projet de fin d'étude : SARS-CoV-2 : Puzzle génomique

Etudiant : ROKHO WISSAL

Filière : LF SVI - Option Biotechnologies Microbiennes

Encadrant : Pr. GUERNAOUI SOUAD

Annèe : 2025

Résumé : SARS-CoV-2 (Sever Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) est un virus à ARN simple brin enveloppé, apparu la première fois, en décembre 2019, à Wuhan, en chine. Il appartient au Genre Betacoronavirus. Anciennement, le syndrome respiratoire aigu sévère (SARS) était causé par le coronavirus CoV-1, plus tard, par le MERS-CoV ou le coronavirus du Syndrome Respiratoire du Moyen-Orient. Le SARS-CoV-2 est responsable de la pandémie COVID-19. La réalisation la plus remarquable durant cette pandémie était le développement rapide des vaccins. Des initiatives mondiales comme COVAX (COVID-19 Vaccines Global Access) ont été mises en place pour garantir un accès équitable aux vaccins, en particulier pour les pays à revenu faible et intermédiaire. Le plus innovant des vaccins était le vaccin à ARNm Moderna, et le plus commercialisé était AstraZeneca ; vaccin à vecteur viral. Bien que les vaccins contre la COVID-19 étaient surs et largement efficaces, certains effets secondaires ont été observés notamment, des maladies auto-immunes, des troubles cardiovasculaires, des inflammations et des troubles menstruels. Néanmoins, l'efficacité des vaccins contre l'infection légère diminue face aux nouveaux variants, notamment, le variant d’Omicron (2021) ; Variant Delta (2023) ; Variant préoccupant (VOC) et JN.1 (2023-2024). Ces variants ont démontrés une transmission soutenue et des propriétés d'évasion immunitaire, qui ont conduit à une chute d''efficacité vaccinale contre les infections. Mots clés : SARS-CoV-2 ; COVID-19 ; COVAX ; Vaccin à ARNm ; Variant ; HMPV.