Etudiant : CHENTOUF SAID

Filière : Master Ecologie et Préservation de l’Environnement pour un Développement Durable (EP2ED)

Encadrant : Pr. GUEMMOUH RAJA

Annèe : 2024

Résumé : L'industrie des arbres de Noël au Canada, qui représente des millions de dollars, connaît actuellement une croissance et une demande constante d'arbres de haute qualité. Chaque année, ce secteur produit environ 3 millions d'arbres dans plus de 1 800 exploitations. La plupart des exploitations d'arbres de Noël cultivent principalement des Abies spp. qui sont sensibles à plusieurs pathogènes fongiques. L'une des maladies les plus importantes affectant ces arbres est la pourriture des racines et le chancre de la tige dus au Phytophthora, qui entraînent des pertes estimées à 9 % de la production par champ, soit environ 9 millions de dollars pour un secteur d'activité de 100 millions de dollars. Cette étude a évalué l'efficacité des traitements de compost dans la suppression de la maladie de la pourriture des racines en utilisant l'analyse du Metabarcoding 16S. Au total, 3502 ASV bactériens et 41 embranchements ont été identifiés. Les embranchements les plus abondants dans les échantillons de Rs-sol étaient les Firmicutes (15-27%), les Proteobacteria (23-25%), et les Planctomycetota (12-18%). De même, les phyla dominants dans le compost étaient les Proteobacteria (20-25%), les Firmicutes (15-20%) et les Planctomycetota (12-17%). Une grande diversité était indiquée par des valeurs de l'indice de Simpson proches de 1, tandis que les résultats de l'indice de Shannon suggéraient que les traitements du compost amélioraient généralement la diversité bactérienne par rapport au contrôle. L'échelle multidimensionnelle non métrique (NMDS) pour les ASV a montré que les embranchements tels que Acidobacteriota et Chloroflexi étaient plus étroitement regroupés, ce qui indique une diversité plus faible et une plus grande similarité au sein de leurs communautés. L'étude a examiné trois types de compost susceptibles d'améliorer la résistance et le développement de la communauté du sol de l'arbre de Noël. Les amendements au compost ont entraîné une augmentation des bactéries bénéfiques du sol, qui sont essentielles pour lutter contre les maladies transmises par le sol et causées par des champignons pathogènes. L'évolution de la communauté microbienne du sol amendé au compost pourrait être liée à l'amélioration du contrôle biotique des organismes pathogènes. Les résultats suggèrent que l'utilisation de traitements au compost peut améliorer la diversité microbienne et la santé du sol dans les exploitations d'arbres de Noël, ce qui pourrait conduire à des pratiques de culture d'arbres plus durables et plus résistantes. Cela pourrait réduire de manière significative les pertes économiques dues aux maladies fongiques et soutenir la croissance de l'industrie.