Etudiant : SENHAJI SOUHAILA

Filière : Master Biotechnologie, Ecologie et Valorisation des Phytoressources (BEVP)

Encadrant : Pr. HAMAMOUCH NOUREDDINE

Annèe : 2024

Résumé : L'étude a porté sur l'isolement et la purification de bactéries endophytes des racines de la vigne (Vitis vinifera L.), révélant leur rôle crucial dans la protection des plantes contre les pathogènes et l'amélioration de leur croissance. Des échantillons de racines ont été collectés et broyés pour isoler 35 souches bactériennes endophytes, cultivées sur des milieux sélectifs à 27°C pendant 24 à 48 heures. Les caractéristiques morphologiques des colonies bactériennes ont été observées et comparées à celles décrites dans la littérature. Parmi les 43 isolats testés, 18 ont montré un pouvoir antagoniste significatif avec des pourcentages d'inhibition de la croissance de Allorhizobium vitis S4 allant de 8,43 % à 30,56 %. Les isolats les plus efficaces étaient : Isolat 3275 : 30,56 %, Bacillus velezensis (3221) : 27,46 %, Bacillus halotolerans (S13- LB1) : 26,16 %, Isolat 3274 : 26,3 %. Lors de la confrontation en milieu liquide avec A. vitis S4, après 24 heures, les souches ont montré des niveaux variables de CFU/ml. Les isolats 3275 et Bacillus halotolerans (S13-LB1) ont présenté les plus hauts niveaux de CFU/ml, suggérant une meilleure survie ou antagonisme. Les meilleures interactions entre les antagonistes, ayant donné une inhibition significative de la croissance de A. vitis S4, étaient : Bacillus subtilis (2515-3) et Bacillus velezensis (3221) : 30,6 % d'inhibition, Bacillus halotolerans (S13-LB1) et Bacillus velezensis (3221) : 25,9 % d'inhibition, Acinetobacter sp. (2332-B5) et Agrobacterium radiobacter (K1026) : 18 % d'inhibition. Les traitements préventifs ont montré une réduction significative de l'incidence et de la taille des tumeurs causées par A. vitis S4 sur les plants de tomate. Rahnella aquatilis (2332-A1) et isolat 3276 ont été les plus efficaces, réduisant l'incidence des tumeurs de 90 %. Les traitements simultanés ont également démontré une efficacité variable contre la croissance tumorale induite par A. vitis S4. Rahnella aquatilis (2332-A) et Bacillus halotolerans (S13-LB1) ont été les plus efficaces, inhibant la croissance tumorale de 70 %. Les tests d'antagonisme in vitro et in vivo ont montré une activité antagoniste significative contre les souches pathogènes de A. vitis S4, avec des zones d'inhibition de croissance autour des spots et des puits des bactéries antagonistes. Les résultats ont été analysés statistiquement avec des tests ANOVA et Tukey utilisant le logiciel R, montrant des différences significatives entre les traitements en termes de souches antagonistes et de souches d'A. vitis S4. Les bactéries endophytes isolées montrent un potentiel prometteur comme agents de biocontrôle, suggérant leur rôle clé dans la protection des plantes et l'amélioration de leur croissance. Des études supplémentaires sont nécessaires pour comprendre les mécanismes d'action et évaluer l'efficacité des souches endophytes en conditions de champ.