Projet de fin d'étude : Evaluation in planta et caractérisation génomique de l’effet biostimulant de bactéries PGPR isolées à partir de la rhizosphère de l’arganier
Etudiant : EL ALAMI EL AROUSSI MOHAMMED
Filière : Master Ecologie et Préservation de l’Environnement pour un Développement Durable (EP2ED)
Encadrant : Pr. EL MESKAOUI ABDELMALEK
Annèe : 2025
Résumé : L’arganier (Argania spinosa (L.) Skeels) revêt une grande importance commerciale mondiale en raison de ses valeurs nutritionnelles, cosmétiques et thérapeutiques. Cependant, malgré ses multiples fonctions et son importance stratégique, l'arganier voit sa régénération compromise par de fortes pressions anthropiques et environnementales. Pour faire face à ce problème, nous avons évalué in planta l’effet biostimulant de bactéries PGPR isolées à partir de l’arganier, ainsi que leurs confrontations avec le champignon Trichoderma afin de formuler un consortium bactéries–Trichoderma. De plus, nous avons caractérisé le génome d’une souche endophyte de l’arganier pour analyser les effets bénéfiques de ses gènes impliqués dans la régénération et le développement de l’arganier. Notre étude a montré que les traitements C2, 180 et 80 présentent respectivement un pourcentage d’évolution de la longueur de la tige de 14,0 ; 13,8 ; et 13,3 %, contre 5,1 % pour le témoin. De plus, pour l’évolution de la teneur en chlorophylle, les traitements B10, C2 et Glomus affichent les valeurs les plus élevées (> 44 %) par rapport au témoin (15,7 %). Par ailleurs, tous les isolats confrontés in vitro avec Trichoderma n’ont montré aucun effet inhibiteur sur le champignon, à l’exception des isolats 5, 9, 16 et ON5. En outre, l’isolat séquencé se regroupe de manière très étroite avec Enterobacter cloacae, avec une valeur de bootstrap élevée (93 %), et présente des gènes associés à des fonctions bénéfiques impliquées dans la régénération et le développement de l’arganier. Ces résultats encourageants ouvrent la voie à compléter l’identification des isolats évalués in planta présentant un potentiel biostimulant par des techniques de biologie moléculaire, notamment le séquençage de l’ADN 16S, voire le séquençage du génome complet. Il est également recommandé de formuler un consortium bactéries–Trichoderma afin de favoriser le développement et la régénération de l’arganier.